מגילות קומרן הן אוסף של כתבי יד עתיקים שנמצאו במערות סמוכות לקומרן, שבמדבר יהודה. המגילות נכתבו בין המאות ה-3 לפנה"ס לשנת 68 לספירה, והן כוללות קטעים מכתבי הקודש היהודיים, כמו גם טקסטים ייחודיים כיתתיים.
חשיבותן של מגילות קומרן היא עצומה. הן מהוות עדות חשובה לתרבות יהודית קדומה, וכוללות גם טקסטים שלא היו ידועים קודם לכן. כמו כן, הן מספקות מידע רב על האמונות והמנהגים של כת האיסיים, שהייתה שונה מהיהדות הרבנית המרכזית באותה תקופה.
המגילות נחשפו במקרה על ידי רועים בדואים ב-1947, והמציאה החשובה הזאת עוררה התלהבות רבה בקרב חוקרים ובקהילה היהודית. מאז, מאות כתבי יד נוספים התגלו באזור, ותרמו לידע שלנו על ההיסטוריה היהודית בימי הבית השני.
פענוח המגילות והפרשנות של התכנים היה אתגר גדול, בשל גילן המופלג והשפות הקדומות שבהן נכתבו. חוקרים רבים עדיין עוסקים בפענוח ובתרגום המגילות, במטרה לחשוף את סודותיהן ההיסטוריים והרוחניים.
מדובר בעלילת מתח מרתקת, שחובה על כל יהודי וחובב דעת להכיר את פרטיה ולבקר באתר קומרן וכן בהיכל הספר.
